GENOMARBETAT EXEMPEL · ATT REPLIKERA EN ARTIKEL I EXCEL

Ett artikelns kompletterande data sammanfattat och kontrollerat mot tabellen

En doktorand som replikerade en artikel från 2025 i PLOS ONE om PM2,5-föroreningar i 337 kinesiska städer laddade upp artikeln och dess kompletterande Excel-fil. De bad om ett sammanfattningsblad med modellkoefficienterna i arbetsboken, kontrollerade mot medelvärdena i artikelns tabell 6, med ett diagram.

skrev sammanfattningen som levande formler, läste tabell 6 från PDF-filen och stämde av alla sex medelvärden. När den bads lägga till den andra kompletterande filen kopierade den bladet, utökade sammanfattningen till tolv faktorer och ritade om diagrammet som ett sorterat stapeldiagram i två färger. De sex nya medelvärdena i tabell 6 krävde en uppföljning.

  • 12 / 12faktorrader som stämmer med vår egen omräkning
  • ≤ 0.0005skillnad från tabell 6, för varje faktor
  • 3förfrågningar, den sista en uppföljning
  • 0.52krediter totalt

Öppna de riktiga filerna

Artikeln och de kompletterande filerna är länkade på PLOS ONE. De tre arbetsböckerna är de som användes i körningen. Ladda ned dem och öppna dem i Excel.

Varifrån filerna kommer: PLOS ONE, ”Identifying the spatiotemporal patterns and natural and socioeconomic influencing factors of PM2.5 and O3 pollution in China” (2025), med sina kompletterande filer S1 och S2. Publicerad under CC BY 4.0. Författarna har inte granskat eller godkänt detta exempel.

01 · STARTFILEN

337 städer, 24 kolumner med koefficienter och en tabell i en PDF

S1-filen har ett blad: en rad per stad och för var och en av sex socioekonomiska faktorer dess lokala koefficient (beta_), standardfel, t-värde och p-värde. S2-filen har samma upplägg för sex naturliga faktorer. Artikeln redovisar medelvärdet av varje koefficient i tabell 6, på sidan 13 i PDF-filen.

S1_File_data_for_Fig5.xlsxföre
A1City
ABCDEFGT
1Citybeta_Popdenbeta_PGDPbeta_Prosecbeta_Energybeta_Roaddenbeta_NDVIp_Popden
2Da Hinggan Ling Mountains0.569-0.0960.0800.025-0.087-0.0670.000
3Heihe0.570-0.0990.1080.025-0.091-0.0690.000
4Yichun0.569-0.1020.1170.025-0.093-0.0720.000
5Hulunbuir0.566-0.1050.0880.025-0.089-0.0630.000
6Qiqihar0.567-0.1060.1110.024-0.092-0.0660.000
…
338Shihezi0.404-0.207-0.0730.037-0.080-0.1300.000
PM2.5_socioeconomic
De första raderna i databladet (kolumnerna A–G och p-värdet för Popden i T; de övriga kolumnerna är dolda här).

02 · BEGÄRAN 1

”Lägg till ett Sammanfattning-blad, kontrollerat mot tabell 6”

Det doktoranden skrev

I'm replicating the PM2.5 paper attached (PLOS ONE 2025). S1_File_data_for_Fig5.xlsx has the local MGWR results for 337 cities on sheet 'PM2.5_socioeconomic' (beta_, se_, t_ and p_ columns for Popden, PGDP, Prosec, Energy, Roadden, NDVI).

In this workbook, add a sheet 'Summary' with one row per factor and these columns:
1. Mean, SD (sample), Min, Median, Max of the beta_ coefficient
2. Number of cities with p < 0.05 (use the p_ column), split into positive and negative beta
3. The mean reported in the paper's Table 6 (PDF page 13), and the difference from our mean

Use formulas pointing at the data sheet where you can. Then add a native Excel bar chart of the six mean coefficients on the Summary sheet. Leave the data sheet unchanged.

Vad gjorde

  • Lade till ett blad ”Sammanfattning” med en rad per faktor: medelvärde, stickprovets standardavvikelse, minimum, median och maximum för varje beta_-kolumn som formler över alla 337 rader.
  • Räknade städer med p < 0,05, uppdelade efter betas tecken, med COUNTIFS på p_- och beta_-kolumnerna.
  • Läste tabell 6 från sidan 13 i PDF-filen, skrev in dess sex medelvärden och lade till en differenskolumn som formel.
  • Lade till ett inbyggt Excel-stapeldiagram över de sex medelvärdena och lämnade databladet orört.
S1_File_data_for_Fig5.xlsxsamma fil
A1Factor
ABCDEFGHIJ
1FactorMean (beta)SD sample (beta)Min (beta)Median (beta)Max (beta)Significant p<0.05, beta>0 (n)Significant p<0.05, beta<0 (n)Paper Table 6 meanDifference (our mean minus paper)
2Popden0.43960.2030-0.00880.38871.089726300.4400-0.0004
3PGDP-0.04060.1479-0.4360-0.05650.30662648-0.04100.0004
4Prosec0.08420.0493-0.08230.10320.1208166160.08400.0002
5Energy0.02070.00510.01410.01960.0439000.0210-0.0003
6Roadden-0.10180.0057-0.1092-0.1029-0.074500-0.10200.0002
7NDVI-0.03110.0358-0.1439-0.02380.015708-0.0310-0.0001
PM2.5_socioeconomicSummaryny
Det nya bladet ”Sammanfattning” som levererats. Gröna tal är formler; klicka på ett för att se det.
S1_File_data_for_Fig5.xlsxSammanfattningsblad

Mean MGWR coefficient (beta) by factor

-0.20.00.20.40.6Mean betaPopdenPGDPProsecEnergyRoaddenNDVIFactorMean (beta) · Popden: 0.440Mean (beta) · PGDP: -0.041Mean (beta) · Prosec: 0.084Mean (beta) · Energy: 0.021Mean (beta) · Roadden: -0.102Mean (beta) · NDVI: -0.031
Diagrammet på bladet ”Sammanfattning”, ritat om här från datan i den levererade filen.

Vi kontrollerade det mot datan: vi räknade om varje statistik från de 337 raderna: alla sex raderna stämmer till tre decimaler, inklusive antalen (Popden 263 positiva, PGDP 26 och 48, Prosec 166 och 16, NDVI 8 negativa), och varje medelvärde stämmer med Tabell 6 till tre decimaler; skillnadskolumnen visar bara avrundningen, högst 0,0004.

03 · BEGÄRAN 2

"Lägg nu till de naturliga faktorerna från den andra filen"

Det doktoranden skrev

Now add the natural factors. In the same workbook:

1. Copy sheet 'PM2.5_natural' from S2_File_data_for_Fig6.xlsx (attached) in as a second data sheet, unchanged.
2. Extend the Summary to all 12 factors (Tem, Pre, Ws, Rh, Ap, Sd below the six socioeconomic ones), same columns, including the Table 6 means.
3. Change the chart to a horizontal bar chart of all 12 means, sorted from largest to smallest, with socioeconomic and natural factors in two different colours and a legend saying which is which.

Don't change the existing six Summary rows.

Vad gjorde

  • Kopierade bladet "PM2.5_natural" från S2-filen till arbetsboken med alla 337 rader.
  • Lade till sex rader för Tem, Pre, Ws, Rh, Ap och Sd med samma formler och lämnade de första sex raderna oförändrade.
  • Byggde en hjälptabell i L1:N13: de tolv medelvärdena sorterade från störst till minst, en kolumn per grupp.
  • Ersatte diagrammet med ett horisontellt stapeldiagram över den tabellen: tolv staplar, socioekonomiska och naturliga faktorer i två färger, med teckenförklaring.
  • Lämnade Tabell 6-medelvärdena för de nya faktorerna tomma: artikeln ingick inte bland de filer som lästes för den här begäran. Slutmeddelandet sa detta och erbjöd sig att fylla i dem om artikeln bifogades.
S1_File_data_for_Fig5.xlsxsamma fil
A1Factor
ABCDEFGHIJ
1FactorMean (beta)SD sample (beta)Min (beta)Median (beta)Max (beta)Significant p<0.05, beta>0 (n)Significant p<0.05, beta<0 (n)Paper Table 6 meanDifference (our mean minus paper)
2Popden0.43960.2030-0.00880.38871.089726300.4400-0.0004
3PGDP-0.04060.1479-0.4360-0.05650.30662648-0.04100.0004
4Prosec0.08420.0493-0.08230.10320.1208166160.08400.0002
5Energy0.02070.00510.01410.01960.0439000.0210-0.0003
6Roadden-0.10180.0057-0.1092-0.1029-0.074500-0.10200.0002
7NDVI-0.03110.0358-0.1439-0.02380.015708-0.0310-0.0001
8Tem-0.52830.3172-0.9254-0.55540.08280282
9Pre-0.29080.2039-0.8050-0.24260.05680164
10Ws0.04240.2451-0.75040.05600.58927724
11Rh0.03650.1642-0.25360.00000.3140525
12Ap0.63540.00890.61440.63540.64863370
13Sd-0.21270.0132-0.2385-0.2124-0.17570337
PM2.5_socioeconomicSummaryPM2.5_naturalny
Sammanfattningsbladet efter begäran 2: de sex naturliga faktorerna (gult), med kolumnerna I och J fortfarande tomma för dem.
S1_File_data_for_Fig5.xlsxSammanfattningsblad

Mean MGWR coefficient (beta) by factor

  • Socioeconomic
  • Natural
Det nya diagrammet, ritat om här från data i den levererade filen.
S1_File_data_for_Fig5.xlsxhjälptabell
L1Factor
LMN
1FactorSocioeconomicNatural
2Ap00.635383529
3Popden0.43959286640
4Prosec0.084240647310
5Ws00.04236848852
6Rh00.0364906784
7Energy0.020651232830
8NDVI-0.031148981010
9PGDP-0.040595839970
10Roadden-0.10181387450
11Sd0-0.2126999148
12Pre0-0.2908334881
13Tem0-0.5282885883
Summary
Kolumnerna L till N på samma blad: de tolv medelvärdena, sorterade och uppdelade i de två serier som diagrammet läser.

Vi kontrollerade det mot datan: de sex nya raderna stämmer med vår omräkning från S2-data, det kopierade bladet innehåller samma siffror som S2-filen, de första sex raderna är oförändrade och diagrammet har två serier med tolv värden i sorterad ordning.

04 · UPPFÖLJNING

"Tabell 6-medelvärdena saknas fortfarande"

Vad studenten skrev, med artikeln bifogad igen

The Table 6 means for Tem, Pre, Ws, Rh, Ap and Sd are still missing in the Summary. They are in Table 6 on page 13 of the paper attached. Please fill them in, with the difference from our mean, like the six socioeconomic rows.

Vad gjorde

  • Läste de sex medelvärdena för naturliga faktorer från Tabell 6 på sida 13 och skrev in dem.
  • Skrev deras skillnader med samma formel som för de första sex raderna.
S1_File_data_for_Fig5.xlsxefter
A1Factor
ABCDEFGHIJ
1FactorMean (beta)SD sample (beta)Min (beta)Median (beta)Max (beta)Significant p<0.05, beta>0 (n)Significant p<0.05, beta<0 (n)Paper Table 6 meanDifference (our mean minus paper)
2Popden0.43960.2030-0.00880.38871.089726300.4400-0.0004
3PGDP-0.04060.1479-0.4360-0.05650.30662648-0.04100.0004
4Prosec0.08420.0493-0.08230.10320.1208166160.08400.0002
5Energy0.02070.00510.01410.01960.0439000.0210-0.0003
6Roadden-0.10180.0057-0.1092-0.1029-0.074500-0.10200.0002
7NDVI-0.03110.0358-0.1439-0.02380.015708-0.0310-0.0001
8Tem-0.52830.3172-0.9254-0.55540.08280282-0.5280-0.0003
9Pre-0.29080.2039-0.8050-0.24260.05680164-0.29100.0002
10Ws0.04240.2451-0.75040.05600.589277240.04200.0004
11Rh0.03650.1642-0.25360.00000.31405250.03600.0005
12Ap0.63540.00890.61440.63540.648633700.63500.0004
13Sd-0.21270.0132-0.2385-0.2124-0.17570337-0.21300.0003
PM2.5_socioeconomicSummaryPM2.5_natural
Sammanfattningsbladet efter uppföljningen: alla tolv rader är kompletta, de naturliga faktorerna i gult.

Vi kontrollerade det mot datan: alla tolv rader stämmer med vår omräkning från de två databladen, och alla tolv Tabell 6-medelvärden är korrekta (Tem −0,528, Pre −0,291, Ws 0,042, Rh 0,036, Ap 0,635, Sd −0,213); S1-databladet är oförändrat och det kopierade S2-bladet innehåller samma siffror.

Replikeringsarbete, i författarnas egna filer

läser artikeln och tilläggsdata tillsammans, skriver statistiken som formler du kan granska och placerar de publicerade siffrorna bredvid, så att eventuella avvikelser syns.

FORTSÄTT LÄSA

Läs ett annat genomarbetat exempel

Se alla 19 genomarbetade exempel Alla exempel för Akademiker